É Pró-Reitora da Universidade NOVA de Lisboa, onde coordena a área da sustentabilidade e a plataforma NOVA 4 The Globe desde Novembro de 2021. Leciona na NOVA School of Science and Technology (NOVA FCT) da Universidade NOVA de Lisboa, onde presidiu ao Departamento de Ciências e Engenharia do Ambiente de 2017 a 2022.

É membro da comissão de ética da NOVA FCT. Foi membro do conselho científico da NOVA FCT entre 2014 e 2020. Coordenou o grupo Energia & Clima no centro de investigação CENSE, entre 2008 e 2021, dedicado a I&D em neutralidade climática e resiliência de sistemas energéticos. Os seus estudos resultaram em mais de uma dezena de peças legislativas e dois documentos de visão, incluindo a Estratégia de Longo Prazo para a neutralidade de carbono da economia portuguesa até 2050, submetida à UNFCCC pelo governo Português.

Júlia Seixas recebeu o reconhecimento pelo Prémio Nobel da Paz da Fundação Nobel em 2007 pelo seu contributo para o Painel Intergovernamental sobre Mudanças Climáticas (IPCC).